0
Dostępne badania
Hodowla bakteryjna
- Izolacja żywego organizmu.
- Typy próbek: kał, zawartość jelit.
- Zalety:
- Bakterie łatwo rosną w 1 dzień.
- Łatwe do wykonania w każdym laboratorium (w tym w przyfermowym).
- Względnie niski koszt.
- Wady:
- Niektóre E. coli są częścią normalnej flory jelitowej.
- Świnie są skolonizowane wieloma szczepami bakterii E. coli w tym samym czasie.
- Z próbek od świń wcześniej leczonych antybiotykami bakterie mogą nie namnażać się.
Wrażliwość na środki przeciwdrobnoustrojowe
- Bada in vitro zdolność żywych organizmów do wzrostu w określonych stężeniach różnych środków przeciwdrobnoustrojowych.
- Typy próbek: kał, zawartość jelit.
- Zalety:
- Identyfikacja wrażliwości lub oporności określonego izolatu na powszechne środki przeciwdrobnoustrojowe.
- Identyfikacja trendów oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe.
- Wady:
- Wymaga izolatu bakteryjnego.
- Testy in vitro mogą nieznacznie różnić się od wyników in vivo.
- Niektóre określone środki przeciwdrobnoustrojowe mogą nie być dostępne do badań lub mogą wymagać oddzielnych, specjalnych testów.
- Umiarkowany koszt.
Histopatologia
- Ocenia obecność zmian w tkankach (uszkodzenia), które mogą potwierdzić obecność choroby. Czasami można również wykryć obecność organizmów bezpośrednio (bakterie i pasożyty) lub pośrednio (wirus) poprzez dodatkowe specjalne barwienie.
- Typy próbek: tkanka.
- Zalety:
- Powiązanie adhezji bakterii z uszkodzeniem jelit.
- Nie jest potrzebne specjalne barwienie.
- Wady:
- Konieczność utrwalenia tkanki jelitowej formaliną w ciągu <15 minut od śmierci świni - tkanka jelitowa szybko się rozkłada.
- Zmiany mogą obejmować tylko niektóre fragmenty jelit, dlatego należy dostarczyć wiele próbek jelit.
Genotypowanie
- Technika reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), która wykrywa obecność określonej sekwencji kwasów nukleinowych (DNA) związanych ze znanymi genami wirulencji.
- Zalety:
- Wykonanie za pomocą PCR; proste do zrobienia.
- Pomaga w identyfikacji patogeniczności poprzez wykrywanie obecności genów (niekoniecznie ekspresji genów) związanych z czynnikami wirulencji.
- Geny toksyn: EAST1, LT, STa, STb, Stx1, Stx2, Stx2e.
- Geny fimbrialne: F18, F41, K88 (F4), K99 (F5), 987P (F6).
- Geny adhezyny: AIDA, EAEA, PAA.
- Pomaga w prawidłowym doborze szczepionki (dopasowywanie odpowiednich fimbrii).
Geny E. coli wykrywane za pomocą PCR.
| Gen | Typ | Opis |
|---|---|---|
| EAST1 | Toksyna | Toksyna jelitowa wiąże się z tym samym receptorem i stymuluje ten sam szlak wydzielania jak Sta (przyczyna biegunki nie jest dobrze poznana) |
| LT | Toksyna | Toksyna jelitowa, która stymuluje wydzielanie jelitowe |
| STa | Toksyna | Toksyna jelitowa, która pobudza wydzielanie jelitowe głównie u młodych świń (zmniejsza wchłanianie wody i elektrolitów) |
| STb | Toksyna | Toksyna jelitowa pobudzająca biegunkę wydzielniczą głównie u starszych świń (zwiększa wydzielanie enterocytów) |
| Stx1 | Toksyna | Toksyny jelitowe można znaleźć w szczepach chorobotwórczych i niepatogennych |
| Stx2 | Toksyna | Toksyny jelitowe można znaleźć w szczepach chorobotwórczych i niepatogennych |
| Stx2e | Toksyna | Toksyna ogólnoustrojowa, która powoduje uszkodzenie naczyń i chorobę obrzękową |
| F18 (F107) | Adhezyna | Fimbrie stosowana do przywierania, która jest obecna po 20 dniu życia i często wiąże się z odsadzeniem i chorobą obrzękową |
| F41 | Adhezyna | Fimbrie używane do przywierania, głównie u noworodków |
| K88 (F4) | Adhezyna | Fimbrie używane do przywierania we wszystkich grupach wiekowych |
| K99 (F5) | Adhezyna | Fimbrie używane do przywierania, głównie u noworodków |
| 987P (F6) | Adhezyna | Fimbrie używane do przywierania, głównie u noworodków |
| AIDA | Adhezyna | Niefimbrialna „adhezyna zaangażowana w rozproszone przyleganie” częściej spotykane w połączeniu z F18 |
| EAE | Adhezyna | Adhezyna niefimbrialna, która przyczynia się do powodowania szeregu zmian patologicznych |
| PAA | Adhezyna | Adhezyna niefimbrialna, niezbędna do tworzenia szeregu zmian patologicznych |
- Wady:
- Wymaga izolatu bakteryjnego
- Nadzieja, że genotypowany jest właściwy izolat (świnie mogą mieć kilka różnych izolatów w tym samym czasie).
- Umiarkowana cena, ale zwykle badany jest tylko 1 izolat.
Interpretacja wyników
Hodowla bakteryjna
- Interpretacja hemolizy zależy od wieku świń:
- Przed odsadzeniem: niehemolityczne E. coli.
- Po odsadzeniu: hemolityczne E. coli.
- Czystość:
- Czysty wzrost: wysoce sugerujący czynnik chorobotwórczy.
- Wzrost mieszany: wątpliwa wartość.
- Liczebność:
- Wysoka: wysoce sugeruje czynnik chorobotwórczy.
- Umiarkowana: zmienna interpretacja.
- Niska: wątpliwa wartość (może być zanieczyszczeniem).
- Brak wzrostu: zwierzę prawdopodobnie wcześniej leczone antybiotykami lub nieistotny czynnik.
Niehemolityczne szczepy E coli (po lewej) i hemolityczne szczepy E coli (po prawej).
Wrażliwość na środki przeciwdrobnoustrojowe
- Wrażliwe: możliwy dobry wybór leczenia, jeśli środek przeciwdrobnoustrojowy może dotrzeć do tkanki docelowej.
- Odporny: wybierz inny środek przeciwdrobnoustrojowy
- MIC: jeśli wykonano MIC, upewnij się, że wybrany środek przeciwdrobnoustrojowy osiąga wymienioną wartość MIC w narządzie docelowym.
Histopatologia
- Obecne zmiany: silny związek z podejrzeniem zakażenia, jeśli jest w stanie wykazać uszkodzenia jelit z E. coli przylegającą do komórek nabłonka.
- Brak zmian: brak uszkodzeń jelit.
Genotypowanie
- Genotypowanie jest bardzo cenne w określaniu, czy izolowana E. coli zawiera którykolwiek z czynników wirulencji, które potwierdzałyby, że izolat jest patogenny.
Scenariusze postępowania
Świnie, u których występuje biegunka (w każdym wieku):
- Pobrać wymazy z odbytu od 2 lub więcej nieleczonych świń, wykonać hodowlę bakteryjną, badanie wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe i genotypowanie.
- Dokonać eutanazji 1-3 nieleczonych świń. Natychmiast pobrać i umieścić w roztworze formaliny po 3 próbki jelit od każdego prosięcia. Zebrać świeże próbki jelit, przesłać je schłodzone na hodowlę bakteryjną, wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe i genotypowanie.
