0
Do identyfikacji i charakterystyki czynnika (ów) etiologicznego związanego z pojawienia się ostrej biegunki u prosiąt w Jiangxi, w Chinach, w marcu 2015 roku, opracowano i zastosowano reakcję łańcuchową polimerazy z odwrotną transkryptazą (RT-PCR) do wykrywania świńskiego deltakoronawirusa (PDCoV).
Badanie bazujące na nested-RT-PCR wykazały obecność monoinfekcji PDCoV (33,71%) i koinfekcji PDCoV (19.66%) z wirusem epidemicznej biegunki świń (PEDV) u wielu chorych, biegunkujących świń w Jiangxi, w Chinach. Zaobserwowano wysoki wskaźnik występowania PDCoV (58,33%) w próbkach kału, które były ujemne na obecność PEDV. Ustalono pełną sekwencję genomu szczepu PDCoV, PDCoV / CHJ xi2 / 2015. Analiza filogenetyczna kompletnego genomu oraz sekwencji białka S PDCoV / CJX2 / 2015 pokazała, że był najbardziej zbliżone do szczepue z Hongkongu i amerykańskich PDCoVs.
Według naszej wiedzy, jest to pierwszy raport na temat identyfikacji, częstości występowania, kompletnego sekwencjonowania genomu oraz molekularnej charakterystyki PDCoV w próbkach biegunkowych u świń w Chinach.
D. Song, et al. Newly Emerged Porcine Deltacoronavirus Associated With Diarrhoea in Swine in China: Identification, Prevalence and Full-Length Genome Sequence Analysis. Transboundary and Emerging Diseases. Volume 62, Issue 6, pages 575–580, December 2015. DOI: 10.1111/tbed.12399
