0
Rotawirusy (RV) są sklasyfikowane w dziewięciu gatunkach lub grupach (RVA-RVD i RVF-RVJ). RVA, RVB i RVC są dobrze znane jako czynniki etiologiczne chorób jelitowych w gospodarstwach trzody chlewnej i zostały zidentyfikowane we wszystkich krajach, w których produkuje się świnie. Natomiast RVH został zidentyfikowany na fermach świń tylko w Japonii, a ostatnio także w Brazylii, USA, RPA i Wietnamie, ale jeszcze nie w Europie. Występowanie RVH zostało zbadane w 103 hiszpańskich stadach świń.
Dziewięć ferm było pozytywnych i uzyskaliśmy kompletne sekwencje nukleotydów w trzech izolatach, podczas gdy inny izolat RVH został częściowo zsekwencjonowany. Średnia identyczność nukleotydów z sekwencjami RVH dostępnymi w GenBank wahała się pomiędzy 69.4% a 93.7%. Filogenetycznie, wszystkie segmenty genomowe hiszpańskiego izolatu RVH były blisko spokrewnione z innymi świńskimi szczepami RVH, ale były odległe od ludzkiego RVH, jak również od szczepu RVH nietoperzy.
Według naszej najlepszej wiedzy, jest to pierwsze doniesienie o RVH na fermach świń w Europie, w tym jego charakterystyka za pomocą sekwencjonowania pełnego genomu.
Puente H, Cortey M, de Nova PJG, et al. First identification and characterization of rotavirus H in swine in Spain. Transboundary and Emerging Diseases. 2021; 00: 1-15. https://doi.org/10.1111/tbed.13992